HOla, para activar las Quotas de Disco en plesk, deben entrar a 
/etc/fstab
editar ese archivo y añadir usrquota justo despues de defaults
Ejemplo:
LABEL=/home /home ext3 defaults,usrquota 1 2
Y a continuación ejecutar esto:
quotaoff -av
quotacheck -avum
quotaon -av
Al final debe reiniciar el servidor.
FUENTE: http://forum.parallels.com/showthread.php?72591-Hard-Disk-Quota-is-not-supported